学校以中医药、壮瑶医药研究为重点，加强科研创新基地与科技创新平台建设，广西中医药科学实验中心是全国中医药民族医药最大的创新共享平台之一。有1个中-泰传统药物研究联合实验室，4个国家中医药管理局中医药科研三级重点实验室，3个广西壮族自治区重点实验室，1个广西壮族自治区重点实验室培育基地，拥有广西首批“2011协同创新中心”各1个，广西“2011协同创新中心”建设基地2个、校地校企共建科技创新平台3个。
近三年来，学校共承担国家级科研项目126项，省部级项目178项，厅局级项目633项。学校获得各级各类科技奖励63项，其中省部级以上奖励30项。出版科技专著62部，发表科技论文3524篇，其中SCI收录论文137篇；获国家专利授权60项，软件著作权登记2项。
学校坚持“以服务为宗旨，在贡献中求发展”，积极投身地方经济社会主战场。加快科研成果转化。以学校第一附属医院、附属瑞康医院、制药厂为依托，学校有36个国药准字号药品、200多种院内制剂、10多种成果转化产品，复方扶芳藤合剂、龙血竭、芒果止咳片已成为广西中医药大学制药厂的拳头产品，青蒿素、绞股蓝等系列产品也为广西多个制药企业的发展创造了良好的经济效益。“大宗农作物废弃物功能成分筛选及产品开发研究”及“海水无核珍珠产业化养殖关键技术与应用”等研究成果转化投入生产，产生了显著的经济效益和良好的社会效益，为地方经济建设作出重要贡献。
医疗卫生技术协作帮助企事业单位解决难题。近年来，学校利用中药药效筛选实验室等省级重点实验室和两所直属附属医院的“国家药品临床研究基地”等系列技术平台，学校先后为区内外25个省区的100多家医药企业、科研院所或个人提供技术服务，完成了上百个中医药品种的处方论证、毒理试验、药效筛选与评价等研究，产生了很好的经济效益和社会效益。同时学校还提供原料检测、中药质量真伪优劣评价，中药农药残留等技术服务，长期与广西各医药企事业单位、科研院所进行质量标准、成分提取、含量测定等方面的合作研究，从而建立起中医药科技服务平台。
