南京大学医学院在南京大学雄厚的基础学科优势、依托多所高水平综合性、专科性医院的支持，精心探索，走出了一条独具特色的办学之路。恢复建院三十年来，始终遵循南京大学整体教学指导思想，坚持文、理、医结合办学，率先提出“自然科学向基础医学渗透、基础医学向临床医学渗透，加强对学生的科研训练，培养学生的创新能力”的教学指导方针，目标是培养杰出的领导型临床学家和医学科学家，形成了鲜明的“精品式、研究型、国际化”的办学特色。
以南京鼓楼医院、南京军区南京总医院（金陵医院）和南京口腔医院作为附属医院，并以南京市各专科医院作为教学医院，师资力量雄厚，现有中国工程院院士2人，博士生导师105人，教授116人，副教授150人。近三年获国家科技进步一等奖1项、二等奖1项，获教育部高等学校科技进步一等奖5项、二等奖2项。近三年获国家重大科研项目8项，国家自然科学基金204项，总累计科研经费约1.7亿元。
凭借南京大学雄厚的自然科学基础，浓郁的学术和人文氛围，本院尤其注重加强学生的基础理论、创新思维及科研能力和人文素质的培养，教学内容反映现代水平，并开设大量与现代医学理论和临床有关的通识通修课，使学生既具有广博而坚实的生命科学和自然科学基础，又掌握现代医学理论和必要的临床知识与实践机能。
费标准及奖助学措施
我校本科各专业学费按照江苏省调整后的有关标准新规定另行公布。住宿费标准为人民币1200元/年。
我校承诺不让任何一个学生因为家庭经济困难而辍学，积极通过奖学金、助学金、国家助学贷款、勤工助学、临时困难补助、学杂费减免、家庭经济困难学生入学绿色通道等方式帮助学生完成学业。
临床医学专业
本院临床医学专业课程体系分为三大模块（见图1）：模块1：通识教育；模块2：基础医学；模块3：临床医学，与学校的三阶段课程体系形成一个二维结构图（见图2）。由如下系列构成：（1）通识通修课：七类通识课程，思想政治理论课，军事技能课，分层次通修课，共68学分；（2）学科专业课：医学学科平台课和专业核心课137.5学分；（3）开放选修课：专业选修课临床医学专业26学分。本院临床医学专业和口腔医学专业选修课均开放供全校学生学习，每门课程限额200人；（4）实验室轮转(Lab Rotation)及学年论文：4学分；（5）实习52周12学分（6）学科定向实习和毕业论文18学分。
口腔医学专业
本院口腔医学专业课程体系分为三大模块（见图3）：模块1：通识教育；模块2：基础医学；模块3：口腔医学。由如下系列构成：（1）通识通修课：七类通识课程，思想政治理论课，军事技能课，分层次通修课，共68学分；（2）学科专业课：医学学科平台课和专业核心课151.5学分；（3）开放选修课：专业选修课17.5学分。本院临床医学专业和口腔医学专业各专业选修课均开放供全校学生学习，每门课程限额200人；（4）实验室轮转(Lab Rotation)及学年论文：4学分；（5）实习52周12学分；（6）学科定向实习和毕业论文12学分。
