管理体制的创新为学校的发展提供了制度保障。管理系统包括教学管理、科学研究和许多其他方面的内容。通过改造管理体系，搭建培养人才的平台。改革管理体制基本上要求：科学设置专业，使其与产业需求相联系；将课程内容与职业标准相衔接，把教学过程与生产过程融为一体；尝试着与校企联合招生、联合培养的招生模式；鼓励教师到企业中进行科研、顶岗实习，了解一线生产情况；在企业当中聘请优秀的工程技术人员、高技能人才到学校担任专兼职教师；鼓励教师去企业中承接项目，获取科研经费；积极参与企业技术研究、产品生产，做好科技服务工作。
南昌大学江西医学院（医学部）的前身是创办于1921年的江西公立医学专门学校。1952年改名为江西省医学院，1953年更名为江西医学院。1958年，与中国人民解放军第八军医学校合并，仍称江西医学院。1969年，与江西中医学院合并，成立江西医科大学。1972年11月与江西中医学院分设，复名为江西医学院。2005年8月，与南昌大学合并，冠名为南昌大学医学院。2014年，南昌大学实施医学教育管理体制改革，学院对内冠名为南昌大学医学部，对外冠名为南昌大学江西医学院。
九十多年来，南昌大学江西医学院（医学部）秉承“德高医精”的办学精神，发扬“严谨、勤奋、团结、创新”的院风，为国家培养了大批优秀医学人才，在海内外建功立业，涌现出了赵白鸽、饶毅、丁健、梅林等一批杰出校友。
南昌大学江西医学院（医学部）现有东湖校区和前湖校区两个校区，占地面积68.24万平方米(1024亩)。目前，前湖校区为低年级本科生教育基地，东湖校区为高年级本科生和研究生教育基地。
本科生教育：现有学院（中心）13个，全日制本科生7585人（其中中英联合办学项目1111人），MBBS留学生330人，公派留学生20人，全日制普通本科专业14个，国家级特色专业1个。
研究生教育：现有全日制硕士研究生2791人，博士研究生88人；同等学力硕士研究生1974人，在职博士研究生634人。一级学科博士点3个(临床医学、基础医学、药学)，自主设置二级博士点2个（临床病理与病理生理学、牙医学）；一级学科硕士点8个，二级学科硕士点45个。
师资力量：现有专任教师229名，其中具有博士学位的教师107人，正高职称66名；临床教师1172名，其中具有博士学位的教师225名，正高职称234名。现有国家“千人计划”人选2名，教育部“长江学者”特聘教授2名，“国家杰出青年科学基金”获得者1名，“百千万人才工程”国家级人选4名，教育部“新（跨）世纪优秀人才支持计划”1名，“万人计划”百千万工程领军人才1名，江西省“井冈学者”特聘教授3名。
学科和科研平台建设：临床医学博士后科研流动站1个，教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队1个，教育部工程研究中心1个，国家临床重点专科9个，国家药物临床试验机构3个，院士工作站2个，海智计划工作站1个。目前临床医学进入ESI学科世界排名前3.8‰。有江西省2011协同创新中心2个，江西省重点实验室或工程技术研究中心34个，江西省优势科技创新团队9个，江西省高校高水平重点实验室或工程研究中心4个，江西省临床医学研究中心5个，江西省高水平重点学科2个，江西省高校重点学科3个，江西省高水平大学整体建设“一流学科”建设立项学科1个。
科技创新能力和水平：近5年，医学部承担了国家、省部级和横向科研项目近4000项。其中，国家重大科技专项等项目课题20项，国家自然科学基金项目550余项（含重点项目2项），总经费达4亿元。发表学术论文4200余篇，其中SCI收录论文1200余篇，ESI高被引论文10余篇。获授权发明专利20余项，省部级以上科技奖励项目74项，其中一、二等奖22项。2017年，医学部获批国家自然科学基金委医学部项目147项，在全国医学院校中排名第17位。
未来几年，南昌大学江西医学院（医学部）将以改革创新为动力，以提升质量为核心，以人才培养为根本使命，以教育教学、科学研究及社会服务为中心任务，大力推进内涵建设，全面提升办学实力，为使医学部建设成为“特色鲜明、国内一流的医学教育基地”打下坚实的基础。
