矿环学院
矿业与环境工程学院与学校同发展、共成长，六十一年的耕耘与拼搏，矿环学院已建成专业结构合理、师资力量雄厚、教学实训条件完善、办学成果辉煌的教学院系。矿环学院开办有煤矿开采技术、地下工程与隧道工程技术、环境监测与治理技术、安全技术管理、矿井通风与安全、煤层气抽采技术、煤化工生产技术等7个高职专科专业和安全工程应用本科专业。现有36个教学班级，全日制在校学生近1300人，成人大中专函授学员1000余人，每年通过矿长资格、安全资格等培训各类短期学员2000余人。各专业毕业生就业率达99%，专业对口率超过90%，就业质量高，深受社会青睐。
地测学院
地质与测绘工程学院开办有工程测量技术、地籍测绘与土地管理信息技术、水文地质与工程地质、地质灾害防治技术、矿山地质、矿山测量共6各专科专业，另开办了1个资源勘查本科专业（与科技学院联办），其中有国家级重点建设专业2个（工程测量技术专业、水文与工程地质地质专业）。地质学院有在校班级31个，学生人数1181人，大专函授生300余人。各专业一次性就业率连续5年在98%以上，社会需求人数与毕业生人数之比达2﹕1。
建筑工程学院
建筑工程学院作为重庆工程职业技术学院的二级学院，办学地点在学校巴南校区，坐落在重庆市巴南区花溪河畔，西临长江、东靠南温泉风景区，北接江南大学城，重庆内环高速公路环校而过，校园环境清馨、优雅，是广大学子求学的理想场所。建筑工程学院现开设有建筑工程技术、工程造价、道路桥梁工程技术三个专业，在校全日制大专学生1800余人，是重庆工程职业技术学院学生最多的二级学院。
艺术设计系
艺术设计系各专业办学历史悠久、特色鲜明，师资力量雄厚，知识结构合理，教学经验丰富：艺术设计系设有建筑装饰工程技术、装饰艺术设计（室内设计方向和环境艺术设计方向）、装潢艺术设计（视觉传达设计方向）、产品造型设计（家具设计方向）、人物形象设计5个专业，其中，建筑装饰工程技术专业是国家财政重点建设的国家示范建设专业群专业。系内现有专兼职教师30人，其中高级职称9人，中级职称16人，硕士研究生20人，双师素质教师28人；此外，艺术设计系还聘任了一批校外专家学者为客座教授。
