新疆巴音郭楞蒙古自治州卫生学校全日制正式学籍预科、一、二年级南疆四地州(阿克苏地区、克州、喀什地区和和田地区)和内地11连片贫困山区的学生享受国家助学金政策。其余学生20%享受。助学金每人每学期￥1000元。
学校坚持公平、公正、公开、择优录取的原则，立足巴州、面向全疆招生，立足中专、面向高职和专科教育，在全疆范围内招收应(历)届初(高)中毕业生。对于学生的就业，学校历来十分重视，除积极向各医疗卫生单位推荐、组织毕业生参加有关部门的人才交流会外，还通过举办每年一届的毕业生学校供需见面会，扩大学校的影响面，提高毕业生的就业率。另外，为了进一步提高学生就业竞争力，在劳动和社会保障部门的指导下，开展职业技能培训工作，使学生在取得毕业证的同时，又能取得由劳动和社会保障部门颁发的职业技能资格证书。一系列的举措，为学生的就业提供了更大的保证。
学校占地面积81244.96平方米，教学行政用房面积40952.42平方米。教学仪器设备总值1130.0万元。教学用计算机238台,电子阅览室1间,多媒体教室11间，语音室1间，多功能学术厅1间，大礼堂1座。图书馆建筑面积1816.0平方米，有纸质藏书6万册，电子图书及其它视听资料30万册。运动场所总面积15326平方米，包括300米塑胶环形跑道，600平方米的室内运动场地，能够满足体育教学和各类活动的需要。 学校现设有护理、临床、语言等9个教研组。建有护理示教室、护理技术综合训练室、ICU模拟病房、妇幼爱婴模拟病房、医学综合训练室等专业实验室42间。有护理、助产、卫生保健、药剂等9个中职医学专业，建立了34个稳定的校外实训基地。
以邓小平理论、“三个代表”重要思想和“三个面向”为指导，以《教育法》、《教师法》、《职业教育法》、《中国教育改革和发展纲要》和《中共中央国务院关于深化教育改革全面推进素质教育的决定》为依据；以深化改革，提高教学质量为原则；以特色兴校，人才强校，质量建校为宗旨；以培养学生的创新精神和实践能力为重点，把学校建成疆内知名、国内有一定影响的中等卫生职业学校。 以德育为首位、以教学为中心、以质量为根本、以管理为手段、以创新为动力、以就业为导向。 全面贯彻党和国家的教育方针，遵守国家法律、法规、致力于培养合格的医学人才，促进卫生事业的健康发展。 学校坚持公平、公正、公开、择优录取的原则，立足巴州、面向全疆招生，立足中专、面向高职和专科教育，在全疆范围内招收应（历）届初（高）中毕业生。对于学生的就业，学校历来十分重视，除积极向各医疗卫生单位推荐、组织毕业生参加有关部门的人才交流会外，还通过举办每年一届的毕业生学校供需见面会，扩大学校的影响面，提高毕业生的就业率。另外，为了进一步提高学生就业竞争力，在劳动和社会保障部门的指导下，开展职业技能培训工作，使学生在取得毕业证的同时，又能取得由劳动和社会保障部门颁发的职业技能资格证书。一系列的举措，为学生的就业提供了更大的保证。
新疆巴音郭楞蒙古自治州卫生学校现开设有 护理、 助产、 卫生保健、 药剂、 医学检验技术、 医学影像技术、 中西医结合、中医针灸推拿、 眼视光技术等9个专业。
