学校是重庆市示范性高等职业院校、重庆市优质高等职业院校立项建设单位、中国青少年心理健康、性健康、防艾及慈善教育示范学校、重庆市出国卫生人员培训基地、首批全国职业院校养老服务类示范专业点、首批全国职业院校健康服务类示范专业点。学校是教育部高职高专药学专业、中药学专业、护理专业、医学检验技术专业、康复治疗技术专业骨干教师国家级培训项目基地，国家卫生职业技能鉴定站，国家执业医师考试实践技能考试站。学校是教育部药学专业、护理专业、食品营养与检测专业教学资源库建设牵头单位，是中国护理职业教育联盟副理事长单位，是教育部、卫生部“专科临床医学（3+2）卓越医生教育培养计划项目”试点学校，是教育部中医学专业现代学徒制试点学校，是全国第一家定向培养基层卫生专业直招士官的医药卫生行业学校。
学校先后荣获全国卫生系统先进单位、全国五四红旗团委、全国教科文卫体系统先进工会组织、全国“巾帼文明岗”、全国女职工培训示范学校、全国大学生“三下乡”社会实践先进团队、全国“青爱工程”十大标杆学校等称号，荣获重庆市文明单位、重庆市职业技术教育先进集体、重庆市高等学校教学质量与教学改革工程先进单位、重庆市大中专毕业生就业工作先进集体、重庆市德育特色学校、重庆市五一劳动奖状等殊荣。学校获得全国高职高专药品（药学）类专业建设成果优秀奖、国家“黄炎培优秀理论奖”和重庆市“黄炎培优秀学校奖”。
学校面向全国17个省市招生，有全日制普通大专学生近12000人。学校开设有药学、护理、医学检验技术、临床医学、中医学、助产、康复治疗技术、医学美容技术、药品生产技术、制药设备应用技术、药品经营与管理、药品质量与安全、中药学、卫生检验与检疫技术、食品营养与检测、针灸推拿、眼视光技术、医学影像技术、医疗设备应用技术等19个大专专业，形成了全日制教育、成人教育、继续教育等多层次办学格局。
学校坚持“校企院合作、集团化办学”的办学模式，联合全国172家知名职业院校、医疗卫生机构和医药企业，牵头成立了重庆医药职业教育集团。依托职教集团，成立了校院企深度合作的“亚信学院”、“太极学院”、“鸿翔学院”、“华博学院”、“迈克学院”、“忆念美学院”、“宽仁康复学院”、“助产士学院”、“柯渡医疗设备管理维护工程中心”、“希尔安班”等。有近三分之一的毕业生在集团内就业。学校有中央财政支持的药物制剂技术高等职业教育实训基地和护理高等职业教育实训基地、有地方财政支持的生物制药技术高等职业教育实训基地；有重庆市高职高专院校中首家工程技术研究中心、重庆高校中首家模拟GMP药学实训工厂。有重庆市医学检验试剂研究所等独立设置的研究机构；有1所附属医院、11所非直管附属医院、18所教学医院及大中型制药厂、医药公司、医院等校外实习基地100多家。近三年毕业生平均就业率98%以上，学生职业资格考试通过率、双证获取率97%以上，专业对口率96%以上。重庆市教育评估院最近连续三年评估数据显示，我校毕业生就业率、就业质量等多项指标名列全市高职高专院校前茅。
学校位于文化氛围浓郁的重庆大学城，这里青山常翠、碧水常流，高校云集、英才荟萃，这里资源共享、教师互聘、学分互认、课程互选、信息互通。新型的教育城、人才城、科技城、生态城为重庆医药高等专科学校提供了得天独厚的发展空间。
